个人所得税退付手续费是指企业在代扣代缴员工个人所得税时，从税务机关获得的所扣缴税款的手续费。
政策依据
根据《中华人民共和国个人所得税法》第十七条规定，对扣缴义务人按照所扣缴的税款，付给百分之二的手续费。这意味着企业在代扣代缴个人所得税时，可以从税务机关获得相当于所扣缴税款2%的手续费作为奖励。
申请流程
企业申请个人所得税退付手续费的流程如下：
1、登录自然人电子税务局：扣缴单位财务人员需登录自然人电子税务局（扣缴端）。
2、进入退付手续费核对功能：在“代扣代缴”页面，找到“退付手续费核对”模块。
3、获取并核对结报单信息：系统会自动带出单户核对清册，财务人员需核对单位年度扣缴税款信息。
4、提交退税申请：核对无误后，点击“申请退库”，系统会弹出“代扣代缴手续费退费申请”，财务人员需填写银行账户信息并提交。
5、等待税务机关审核：提交申请后，税务机关及国库将进行审核，审核通过后，手续费将退到扣缴义务人指定的银行账户内。
税务处理
1、增值税处理：企业收到的个税手续费返还一般需要按“商务辅助服务-代理经纪服务”缴纳增值税。一般纳税人税率为6%，小规模纳税人征收率为3%，目前有3%减按1%征收的优惠政策。
2、企业所得税处理：企业收到的个税手续费返还需计入当年收入总额，缴纳企业所得税。同时，与该项工作相关的符合条件的支出，可以在企业所得税前扣除。
3、个人所得税处理：如果企业将收到的个税手续费返还用于直接奖励办税人员，是否需要缴纳个人所得税存在争议。不同地方税务机关可能有不同的执行口径，具体需以当地税务机关的规定为准
个人所得税退付手续费政策旨在鼓励企业积极履行代扣代缴职责，确保税款及时、足额入库。企业应严格按照政策规定和操作流程申请退付手续费，并合规进行税务处理，以免产生税务风险。
